PrecisionFDA
Truth Challenge

Engage and improve DNA test results with our community challenges

Explore HG002 comparison results
Use this interactive explorer to filter all results across submission entries and multiple dimensions.
EntryTypeSubtypeSubsetGenotypeF-scoreRecallPrecisionFrac_NATruth TP Truth FNQuery TPQuery FPFP gt% FP ma
71651-71700 / 86044 show all
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRlt7_gt200bp_gt95identity_merged*
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRlt7_gt200bp_gt95identity_mergedhet
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRlt7_gt200bp_gt95identity_mergedhetalt
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRlt7_gt200bp_gt95identity_mergedhomalt
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRlt7_lt101bp_gt95identity_mergedhetalt
0.0000
100.0000
02000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRlt7_lt51bp_gt95identity_mergedhetalt
0.0000
100.0000
02000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_diTR_11to50hetalt
0.0000
0.0000
96.6667
01011
100.0000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200hetalt
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_diTR_gt200*
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_diTR_gt200het
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_diTR_gt200hetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_diTR_gt200homalt
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_homopolymer_gt10*
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_homopolymer_gt10het
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_homopolymer_gt10hetalt
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_homopolymer_gt10homalt
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_quadTR_51to200hetalt
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_quadTR_gt200*
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_quadTR_gt200het
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_quadTR_gt200hetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_quadTR_gt200homalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_triTR_11to50hetalt
0.0000
100.0000
01000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_triTR_51to200*
0.0000
0.0000
92.2078
010180
0.0000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_triTR_51to200het
0.0000
0.0000
91.2621
010180
0.0000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_triTR_51to200hetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_triTR_51to200homalt
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_triTR_gt200*
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_triTR_gt200het
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_triTR_gt200hetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvlowcmp_SimpleRepeat_triTR_gt200homalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvmap_l250_m0_e0hetalt
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvsegdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvsegdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvsegdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvsegdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapplatSNPtvtech_badpromotershetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapvardINDEL*decoyhetalt
0.0000
0.0000
0.0000
01000
gduggal-snapvardINDEL*func_cdshetalt
0.0000
0.0000
0.0000
05000
gduggal-snapvardINDEL*lowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRlt7_gt200bp_gt95identity_merged*
0.0000
100.0000
03000
gduggal-snapvardINDEL*lowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRlt7_gt200bp_gt95identity_mergedhet
0.0000
100.0000
02000
gduggal-snapvardINDEL*lowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRlt7_gt200bp_gt95identity_mergedhetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapvardINDEL*lowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRlt7_gt200bp_gt95identity_mergedhomalt
0.0000
100.0000
01000
gduggal-snapvardINDEL*lowcmp_SimpleRepeat_diTR_gt200*
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapvardINDEL*lowcmp_SimpleRepeat_diTR_gt200het
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapvardINDEL*lowcmp_SimpleRepeat_diTR_gt200hetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapvardINDEL*lowcmp_SimpleRepeat_diTR_gt200homalt
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapvardINDEL*lowcmp_SimpleRepeat_quadTR_gt200*
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapvardINDEL*lowcmp_SimpleRepeat_quadTR_gt200het
0.0000
100.0000
00000
gduggal-snapvardINDEL*lowcmp_SimpleRepeat_quadTR_gt200hetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
gduggal-snapvardINDEL*lowcmp_SimpleRepeat_quadTR_gt200homalt
0.0000
100.0000
00000