PrecisionFDA
Truth Challenge

Engage and improve DNA test results with our community challenges

Explore HG002 comparison results
Use this interactive explorer to filter all results across submission entries and multiple dimensions.
EntryTypeSubtypeSubset GenotypeF-scoreRecallPrecisionFrac_NATruth TPTruth FNQuery TPQuery FPFP gt% FP ma
3201-3250 / 86044 show all
dgrover-gatkSNPtisegdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNPtisegdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNPtisegdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNPtisegdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI1_5segdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI1_5segdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI1_5segdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI1_5segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELD6_15segdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELD6_15segdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELD6_15segdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELD6_15segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI16_PLUSsegdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI16_PLUSsegdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI16_PLUSsegdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI16_PLUSsegdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNP*segdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNP*segdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNP*segdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNP*segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD6_15segdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD6_15segdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD6_15segdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD6_15segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELC16_PLUSsegdupwithalt*
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC16_PLUSsegdupwithalthet
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC16_PLUSsegdupwithalthetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC16_PLUSsegdupwithalthomalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC1_5segdupwithalt*
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC1_5segdupwithalthet
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC1_5segdupwithalthetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC1_5segdupwithalthomalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELI1_5segdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI1_5segdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI1_5segdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI1_5segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD1_5segdupwithalt*
100.0000
100.0000
100.0000
99.9960
10100
ckim-vqsrINDELD1_5segdupwithalthet
100.0000
100.0000
100.0000
99.9946
10100
ckim-vqsrINDELD1_5segdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD1_5segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELC6_15segdupwithalt*
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC6_15segdupwithalthet
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC6_15segdupwithalthetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC6_15segdupwithalthomalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELD16_PLUSsegdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD16_PLUSsegdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD16_PLUSsegdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD16_PLUSsegdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI16_PLUSsegdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI16_PLUSsegdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000