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| Entry | Type | Subtype | Subset | Genotype | F-score | Recall | Precision | Frac_NA | Truth TP | Truth FN | Query TP | Query FP | FP gt | % FP ma | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
36651-36700 / 86044 show all | |||||||||||||||
| ltrigg-rtg2 | SNP | ti | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 0.0000 | 0.0000 | 100.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | ||
| ltrigg-rtg2 | SNP | ti | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 80.0000 | 66.6667 | 100.0000 | 93.6508 | 4 | 2 | 4 | 0 | 0 | ||
| ltrigg-rtg2 | SNP | tv | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | * | 75.7426 | 65.3846 | 90.0000 | 93.5691 | 17 | 9 | 18 | 2 | 1 | 50.0000 | |
| ltrigg-rtg2 | SNP | tv | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | het | 72.8477 | 64.7059 | 83.3333 | 95.1613 | 11 | 6 | 10 | 2 | 1 | 50.0000 | |
| ltrigg-rtg2 | SNP | tv | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 0.0000 | 0.0000 | 100.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | ||
| ltrigg-rtg2 | SNP | tv | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 80.0000 | 66.6667 | 100.0000 | 88.7097 | 6 | 3 | 7 | 0 | 0 | ||
| mlin-fermikit | INDEL | * | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | * | 52.7192 | 50.5474 | 55.0862 | 52.4074 | 1062 | 1039 | 991 | 808 | 803 | 99.3812 | |
| mlin-fermikit | INDEL | * | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | het | 38.5511 | 68.5714 | 26.8126 | 57.5000 | 336 | 154 | 196 | 535 | 531 | 99.2523 | |
| mlin-fermikit | INDEL | * | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 47.0332 | 30.8307 | 99.1285 | 43.6118 | 386 | 866 | 455 | 4 | 3 | 75.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | * | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 70.2479 | 94.7075 | 55.8292 | 51.1236 | 340 | 19 | 340 | 269 | 269 | 100.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | C16_PLUS | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | * | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| mlin-fermikit | INDEL | C16_PLUS | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | het | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| mlin-fermikit | INDEL | C16_PLUS | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| mlin-fermikit | INDEL | C16_PLUS | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| mlin-fermikit | INDEL | C6_15 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | * | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| mlin-fermikit | INDEL | C6_15 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | het | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| mlin-fermikit | INDEL | C6_15 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| mlin-fermikit | INDEL | C6_15 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| mlin-fermikit | INDEL | D16_PLUS | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | * | 69.4218 | 66.5306 | 72.5758 | 57.3368 | 489 | 246 | 479 | 181 | 180 | 99.4475 | |
| mlin-fermikit | INDEL | D16_PLUS | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | het | 48.0237 | 81.0651 | 34.1176 | 68.8073 | 137 | 32 | 58 | 112 | 111 | 99.1071 | |
| mlin-fermikit | INDEL | D16_PLUS | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 68.3658 | 51.9362 | 100.0000 | 43.6433 | 228 | 211 | 297 | 0 | 0 | ||
| mlin-fermikit | INDEL | D16_PLUS | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 77.5000 | 97.6378 | 64.2487 | 59.3684 | 124 | 3 | 124 | 69 | 69 | 100.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | C1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | * | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| mlin-fermikit | INDEL | C1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | het | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| mlin-fermikit | INDEL | C1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| mlin-fermikit | INDEL | C1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| mlin-fermikit | INDEL | D1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | * | 41.4591 | 33.4290 | 54.5667 | 44.1830 | 233 | 464 | 233 | 194 | 191 | 98.4536 | |
| mlin-fermikit | INDEL | D1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | het | 41.1619 | 58.5185 | 31.7460 | 42.9003 | 79 | 56 | 60 | 129 | 126 | 97.6744 | |
| mlin-fermikit | INDEL | D1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 31.5161 | 18.7373 | 99.1071 | 42.5641 | 92 | 399 | 111 | 1 | 1 | 100.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | D1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 62.9442 | 87.3239 | 49.2063 | 47.2803 | 62 | 9 | 62 | 64 | 64 | 100.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | D6_15 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | * | 47.8252 | 42.6757 | 54.3879 | 44.5978 | 504 | 677 | 502 | 421 | 421 | 100.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | D6_15 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | het | 31.8686 | 65.5405 | 21.0526 | 51.2162 | 97 | 51 | 76 | 285 | 285 | 100.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | D6_15 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 44.9406 | 29.0138 | 99.6337 | 37.6712 | 253 | 619 | 272 | 1 | 1 | 100.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | D6_15 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 68.4444 | 95.6522 | 53.2872 | 40.7787 | 154 | 7 | 154 | 135 | 135 | 100.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | I16_PLUS | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | * | 33.3333 | 25.0000 | 50.0000 | 93.1034 | 1 | 3 | 1 | 1 | 0 | 0.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | I16_PLUS | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | het | 50.0000 | 100.0000 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | ||||
| mlin-fermikit | INDEL | I16_PLUS | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 0.0000 | 0.0000 | 50.0000 | 66.6667 | 0 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | I16_PLUS | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 0.0000 | 100.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | ||||
| mlin-fermikit | INDEL | I1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | * | 36.6412 | 23.3010 | 85.7143 | 59.4203 | 48 | 158 | 48 | 8 | 8 | 100.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | I1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | het | 32.8502 | 62.9630 | 22.2222 | 78.5714 | 17 | 10 | 2 | 7 | 7 | 100.0000 | |
| mlin-fermikit | INDEL | I1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 29.5238 | 17.3184 | 100.0000 | 39.4737 | 31 | 148 | 46 | 0 | 0 | ||
| mlin-fermikit | INDEL | I1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 0.0000 | 0.0000 | 95.0000 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 100.0000 | ||
| anovak-vg | INDEL | * | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | * | 23.1772 | 16.4208 | 39.3809 | 42.5111 | 345 | 1756 | 458 | 705 | 585 | 82.9787 | |
| anovak-vg | INDEL | * | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | het | 28.9696 | 23.8776 | 36.8222 | 43.6389 | 117 | 373 | 292 | 501 | 425 | 84.8303 | |
| anovak-vg | INDEL | * | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 0.0000 | 7.1086 | 0.0000 | 0.0000 | 89 | 1163 | 0 | 0 | 0 | ||
| anovak-vg | INDEL | * | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 41.5658 | 38.7187 | 44.8649 | 39.9351 | 139 | 220 | 166 | 204 | 160 | 78.4314 | |
| anovak-vg | INDEL | C1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | * | 0.0000 | 100.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | ||||
| anovak-vg | INDEL | C1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | het | 0.0000 | 100.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | ||||
| anovak-vg | INDEL | C1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | hetalt | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| anovak-vg | INDEL | C1_5 | lowcmp_SimpleRepeat_diTR_51to200 | homalt | 0.0000 | 0.0000 | 0.0000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||