PrecisionFDA
Truth Challenge

Engage and improve DNA test results with our community challenges

Explore HG002 comparison results
Use this interactive explorer to filter all results across submission entries and multiple dimensions.
EntryTypeSubtypeSubset GenotypeF-scoreRecallPrecisionFrac_NATruth TPTruth FNQuery TPQuery FPFP gt% FP ma
3201-3250 / 86044 show all
dgrover-gatkSNPtvdecoyhomalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI6_15decoy*
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI6_15decoyhet
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI6_15decoyhetalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI6_15decoyhomalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELD6_15decoyhet
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELD6_15decoyhetalt
100.0000
100.0000
100.0000
99.1379
10100
dgrover-gatkINDELD6_15decoyhomalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI16_PLUSdecoy*
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI16_PLUSdecoyhet
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI16_PLUSdecoyhetalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI16_PLUSdecoyhomalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI1_5decoy*
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI1_5decoyhet
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI1_5decoyhetalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkINDELI1_5decoyhomalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNPtidecoy*
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNPtidecoyhet
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNPtidecoyhetalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNPtidecoyhomalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI16_PLUSdecoy*
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI16_PLUSdecoyhet
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI16_PLUSdecoyhetalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI16_PLUSdecoyhomalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELC1_5decoy*
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC1_5decoyhet
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC1_5decoyhetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC1_5decoyhomalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC6_15decoy*
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC6_15decoyhet
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC6_15decoyhetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELC6_15decoyhomalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
ckim-vqsrINDELI6_15decoy*
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI6_15decoyhet
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI6_15decoyhetalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI6_15decoyhomalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD6_15decoy*
100.0000
100.0000
100.0000
99.9554
10100
ckim-vqsrINDELD6_15decoyhet
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD6_15decoyhetalt
100.0000
100.0000
100.0000
99.2647
10100
ckim-vqsrINDELD6_15decoyhomalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD16_PLUSdecoy*
100.0000
100.0000
100.0000
99.5807
60600
ckim-vqsrINDELD16_PLUSdecoyhet
100.0000
100.0000
100.0000
99.6572
40400
ckim-vqsrINDELD16_PLUSdecoyhetalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELD16_PLUSdecoyhomalt
100.0000
100.0000
100.0000
99.1304
20200
ckim-vqsrINDELD1_5decoy*
100.0000
100.0000
100.0000
99.9751
40400
ckim-vqsrINDELD1_5decoyhet
100.0000
100.0000
100.0000
99.9857
20200
ckim-vqsrINDELD1_5decoyhetalt
100.0000
100.0000
100.0000
99.6933
10100
ckim-vqsrINDELD1_5decoyhomalt
100.0000
100.0000
100.0000
99.9405
10100
ckim-vqsrINDELI1_5decoy*
0.0000
100.0000
00000
ckim-vqsrINDELI1_5decoyhet
0.0000
100.0000
00000