PrecisionFDA
Truth Challenge

Engage and improve DNA test results with our community challenges

Explore HG002 comparison results
Use this interactive explorer to filter all results across submission entries and multiple dimensions.
EntryTypeSubtypeSubset GenotypeF-scoreRecallPrecisionFrac_NATruth TPTruth FNQuery TPQuery FPFP gt% FP ma
83551-83600 / 86044 show all
ckim-isaacSNP*segdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
ckim-isaacSNP*segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
eyeh-varpipeINDELC16_PLUSsegdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
eyeh-varpipeINDELC16_PLUSsegdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
eyeh-varpipeINDELC16_PLUSsegdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
eyeh-varpipeINDELC16_PLUSsegdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELI16_PLUSsegdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELI16_PLUSsegdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELI16_PLUSsegdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELI16_PLUSsegdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELI6_15segdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELI6_15segdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELI6_15segdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELI6_15segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
eyeh-varpipeINDEL*segdupwithalt*
100.0000
100.0000
100.0000
99.9901
10600
eyeh-varpipeINDEL*segdupwithalthet
100.0000
100.0000
100.0000
99.9726
10500
eyeh-varpipeINDEL*segdupwithalthetalt
0.0000
0.0000
100.0000
99.9431
00100
eyeh-varpipeINDEL*segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELI1_5segdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELI1_5segdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELI1_5segdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELI1_5segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaSNPtisegdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaSNPtisegdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaSNPtisegdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaSNPtisegdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaSNPtvsegdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaSNPtvsegdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaSNPtvsegdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaSNPtvsegdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaSNP*segdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaSNP*segdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaSNP*segdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaSNP*segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNPtvsegdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNPtvsegdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNPtvsegdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
dgrover-gatkSNPtvsegdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELC1_5segdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELC1_5segdupwithalthet
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELC1_5segdupwithalthetalt
0.0000
0.0000
0.0000
00000
egarrison-hhgaINDELC1_5segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELC6_15segdupwithalt*
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELC6_15segdupwithalthet
0.0000
0.0000
0.0000
00000
egarrison-hhgaINDELC6_15segdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDELC6_15segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDEL*segdupwithalt*
100.0000
100.0000
100.0000
99.9993
10100
egarrison-hhgaINDEL*segdupwithalthet
100.0000
100.0000
100.0000
99.9952
10100
egarrison-hhgaINDEL*segdupwithalthetalt
0.0000
100.0000
00000
egarrison-hhgaINDEL*segdupwithalthomalt
0.0000
100.0000
00000