PrecisionFDA
Truth Challenge

Engage and improve DNA test results with our community challenges

Explore HG002 comparison results

Use this interactive explorer to filter all results across submission entries and multiple dimensions.

Entry	Type	Subtype	Subset	Genotype	F-score	Recall	Precision	Frac_NA	Truth TP	Truth FN	Query TP	Query FP	FP gt

« 1 2 ... 1659 1660 1661 1662 1663 1664 1665 1666 1667 ... 1720 1721 » 83101-83150 / 86044 show all
ckim-gatk	SNP	ti	segdupwithalt	homalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	SNP	tv	segdupwithalt	*		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	SNP	tv	segdupwithalt	het		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	SNP	tv	segdupwithalt	hetalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	SNP	tv	segdupwithalt	homalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-isaac	INDEL	D1_5	segdupwithalt	*	100.0000	100.0000	100.0000	99.9921	1	0	1	0	0
ckim-isaac	INDEL	D1_5	segdupwithalt	het	100.0000	100.0000	100.0000	99.9889	1	0	1	0	0
ckim-isaac	INDEL	D1_5	segdupwithalt	hetalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-isaac	INDEL	D1_5	segdupwithalt	homalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-isaac	INDEL	D6_15	segdupwithalt	*		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-isaac	INDEL	D6_15	segdupwithalt	het		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-isaac	INDEL	C1_5	segdupwithalt	*		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-isaac	INDEL	C1_5	segdupwithalt	het		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-isaac	INDEL	C1_5	segdupwithalt	hetalt		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-isaac	INDEL	C1_5	segdupwithalt	homalt		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	SNP	*	segdupwithalt	*		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	SNP	*	segdupwithalt	het		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	SNP	*	segdupwithalt	hetalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	SNP	*	segdupwithalt	homalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	SNP	ti	segdupwithalt	*		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	SNP	ti	segdupwithalt	het		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	SNP	ti	segdupwithalt	hetalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	SNP	ti	segdupwithalt	homalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	C16_PLUS	segdupwithalt	*		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	C16_PLUS	segdupwithalt	het		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	C16_PLUS	segdupwithalt	hetalt		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	C16_PLUS	segdupwithalt	homalt		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	*	segdupwithalt	*	100.0000	100.0000	100.0000	99.9981	1	0	1	0	0
ckim-gatk	INDEL	*	segdupwithalt	het	100.0000	100.0000	100.0000	99.9975	1	0	1	0	0
ckim-gatk	INDEL	*	segdupwithalt	hetalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	*	segdupwithalt	homalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	SNP	tv	segdupwithalt	*		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	SNP	tv	segdupwithalt	het		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	SNP	tv	segdupwithalt	hetalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	SNP	tv	segdupwithalt	homalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	INDEL	I1_5	segdupwithalt	het		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	INDEL	I1_5	segdupwithalt	hetalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	INDEL	I1_5	segdupwithalt	homalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	INDEL	I6_15	segdupwithalt	*		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	INDEL	I6_15	segdupwithalt	het		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	INDEL	I6_15	segdupwithalt	hetalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-dragen	INDEL	I6_15	segdupwithalt	homalt		0.0000		100.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	C1_5	segdupwithalt	*		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	C1_5	segdupwithalt	het		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	C1_5	segdupwithalt	hetalt		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	C1_5	segdupwithalt	homalt		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	C6_15	segdupwithalt	*		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	C6_15	segdupwithalt	het		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	C6_15	segdupwithalt	hetalt		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0
ckim-gatk	INDEL	C6_15	segdupwithalt	homalt		0.0000	0.0000	0.0000	0	0	0	0	0

PrecisionFDA Truth Challenge

PrecisionFDA
Truth Challenge