PrecisionFDA
Truth Challenge

Engage and improve DNA test results with our community challenges

Explore HG002 comparison results
Use this interactive explorer to filter all results across submission entries and multiple dimensions.
EntryTypeSubtypeSubsetGenotypeF-scoreRecall PrecisionFrac_NATruth TPTruth FNQuery TPQuery FPFP gt% FP ma
7151-7200 / 86044 show all
ckim-dragenINDEL*lowcmp_SimpleRepeat_triTR_51to200homalt
96.9072
100.0000
94.0000
55.7522
4704733
100.0000
ckim-dragenINDEL*segdupwithalt*
100.0000
100.0000
100.0000
99.9979
10100
ckim-dragenINDEL*segdupwithalthet
100.0000
100.0000
100.0000
99.9970
10100
ckim-dragenINDEL*tech_badpromotershetalt
100.0000
100.0000
100.0000
50.0000
40400
ckim-dragenINDEL*tech_badpromotershomalt
100.0000
100.0000
100.0000
59.2593
3303300
ckim-dragenINDELC1_5*hetalt
80.0000
100.0000
66.6667
87.3684
10844
100.0000
ckim-dragenINDELC1_5HG002compoundhet*
84.2105
100.0000
72.7273
75.0000
10833
100.0000
ckim-dragenINDELC1_5HG002compoundhethetalt
84.2105
100.0000
72.7273
75.0000
10833
100.0000
ckim-dragenINDELC1_5lowcmp_SimpleRepeat_homopolymer_6to10*
66.6667
100.0000
50.0000
60.0000
10111
100.0000
ckim-dragenINDELC1_5lowcmp_SimpleRepeat_homopolymer_6to10het
0.0000
100.0000
0.0000
0.0000
10000
ckim-dragenINDELC1_5lowcmp_SimpleRepeat_triTR_11to50*
0.0000
100.0000
0.0000
0.0000
10000
ckim-dragenINDELC1_5lowcmp_SimpleRepeat_triTR_11to50het
0.0000
100.0000
0.0000
0.0000
10000
ckim-dragenINDELC6_15**
80.0000
100.0000
66.6667
88.4615
70211
100.0000
ckim-dragenINDELC6_15*het
0.0000
100.0000
0.0000
0.0000
70000
ckim-dragenINDELC6_15HG002complexvar*
80.0000
100.0000
66.6667
78.5714
40211
100.0000
ckim-dragenINDELC6_15HG002complexvarhet
0.0000
100.0000
0.0000
0.0000
40000
ckim-dragenINDELC6_15lowcmp_AllRepeats_lt51bp_gt95identity_merged*
80.0000
100.0000
66.6667
87.5000
10211
100.0000
ckim-dragenINDELC6_15lowcmp_AllRepeats_lt51bp_gt95identity_mergedhet
0.0000
100.0000
0.0000
0.0000
10000
ckim-dragenINDELC6_15lowcmp_SimpleRepeat_homopolymer_gt10*
100.0000
100.0000
10000
ckim-dragenINDELC6_15lowcmp_SimpleRepeat_homopolymer_gt10het
0.0000
100.0000
0.0000
0.0000
10000
ckim-dragenINDELD16_PLUSHG002compoundhethomalt
16.8421
100.0000
9.1954
61.3333
8087979
100.0000
ckim-dragenINDELD16_PLUSdecoy*
100.0000
100.0000
100.0000
99.6161
60600
ckim-dragenINDELD16_PLUSdecoyhet
100.0000
100.0000
100.0000
99.6813
40400
ckim-dragenINDELD16_PLUSdecoyhomalt
100.0000
100.0000
100.0000
99.2674
20200
ckim-dragenINDELD16_PLUSfunc_cds*
100.0000
100.0000
100.0000
83.3333
1201200
ckim-dragenINDELD16_PLUSfunc_cdshet
100.0000
100.0000
100.0000
85.1852
80800
ckim-dragenINDELD16_PLUSfunc_cdshomalt
100.0000
100.0000
100.0000
77.7778
40400
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_AllRepeats_gt200bp_gt95identity_mergedhet
100.0000
100.0000
100.0000
99.8641
10100
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_AllRepeats_gt200bp_gt95identity_mergedhetalt
100.0000
100.0000
100.0000
90.0000
10100
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRgt6_51to200bp_gt95identity_mergedhomalt
98.5673
100.0000
97.1751
81.6199
172017251
20.0000
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRgt6_gt200bp_gt95identity_mergedhet
100.0000
100.0000
100.0000
99.8605
10100
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRgt6_gt200bp_gt95identity_mergedhetalt
100.0000
100.0000
100.0000
87.5000
10100
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRgt6_lt101bp_gt95identity_mergedhetalt
100.0000
100.0000
100.0000
70.8861
1902300
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRgt6_lt101bp_gt95identity_mergedhomalt
99.5862
100.0000
99.1758
63.0457
361036131
33.3333
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRgt6_lt51bp_gt95identity_mergedhetalt
100.0000
100.0000
100.0000
41.6667
1201400
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_Human_Full_Genome_TRDB_hg19_150331_TRgt6_lt51bp_gt95identity_mergedhomalt
99.7636
100.0000
99.5283
48.4185
211021110
0.0000
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_SimpleRepeat_homopolymer_6to10*
98.8636
100.0000
97.7528
86.9693
8708720
0.0000
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_SimpleRepeat_homopolymer_6to10het
97.9592
100.0000
96.0000
89.3162
5204820
0.0000
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_SimpleRepeat_homopolymer_6to10hetalt
100.0000
100.0000
100.0000
52.9412
1201600
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_SimpleRepeat_homopolymer_6to10homalt
100.0000
100.0000
100.0000
87.2928
2302300
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_SimpleRepeat_triTR_11to50*
99.0536
100.0000
98.1250
71.7813
157015730
0.0000
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_SimpleRepeat_triTR_11to50het
97.4790
100.0000
95.0820
82.6211
6105830
0.0000
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_SimpleRepeat_triTR_11to50hetalt
100.0000
100.0000
100.0000
23.9437
5105400
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_SimpleRepeat_triTR_11to50homalt
100.0000
100.0000
100.0000
68.9655
4504500
ckim-dragenINDELD16_PLUSlowcmp_SimpleRepeat_triTR_51to200homalt
96.2963
100.0000
92.8571
46.1538
1301311
100.0000
ckim-dragenINDELD16_PLUSmap_l125_m0_e0homalt
100.0000
100.0000
100.0000
98.5612
20200
ckim-dragenINDELD16_PLUSmap_l125_m1_e0homalt
88.8889
100.0000
80.0000
98.0469
40410
0.0000
ckim-dragenINDELD16_PLUSmap_l125_m2_e0homalt
80.0000
100.0000
66.6667
98.0392
40420
0.0000
ckim-dragenINDELD16_PLUSmap_l125_m2_e1homalt
80.0000
100.0000
66.6667
98.0707
40420
0.0000
ckim-dragenINDELD16_PLUSmap_l150_m0_e0*
82.3529
100.0000
70.0000
97.6581
70730
0.0000